Апофиллит образует хорошие кристаллы размером до 5-6 см. Сингония тетроагональная. Различают несколько габитусных типов:
* толсто– и тонко-таблитчатые кристаллы, с преимущественным развитием граней пинакоида
* столбчатые с плоскими торцами; господствующие простые формы – тетрагональная призма и пинакоид
* столбчатые остроконечные с преобладанием тетрагональной дипирамиды, призма развита более или менее, пинакоид совсем отсутствует
Первые два пипа характерны для гидроксиапофиллита, а дипирамиды обычно хорошо развита у фторапофиллита.
Апофиллит также образует сростки, друзы , пучки расщепленных минералов и сферокристаллы.
Примеси ванадия придают минералу зеленый оттенок. Включения хлорита окаршивают кристаллы в серовато-зелёный цвет и делают их непрозрачными.