Вряд ли красивый золотисто-желтый цитрин, который вы увидели в витрине магазина или в интернете являлся таковым от рождения.
С большей вероятностью он был другой более дешевой разновидностью кварца - чаще всего каким-нибудь бледненьким низкокачественным аметистом.
А окраску свое он поменял когда его прокалили в печи.
Это делается по отлаженной технологии, разной для разных видов сырья, а вот в старину на Урале такую процедуру удавалось провести, запекая кристаллы в хлебе.